Представлен обзор современного состояния исследований в области компьютерного моделирования физических и биологических систем методами молекулярной динамики (МД). Рассмотрены особенности компьютерного моделирования молекулярных и атомных систем на базе параллельных и векторных вычислений. Проведены расчеты на основе применения методов МД-моделирования, позволяющие анализировать динамику конденсированных систем (кластеров, жидкостей и т.п.) и явлений нуклеации на молекулярном уровне.

We review the modern state of computer simulation of physical and biological systems based on molecular dynamics method (MD). Special attention is paid to parallel and vector simulation of atomic and molecular systems. The results of the molecular dynamic simulation of the nucleation processes in condensed matter (liquids, clusters, etc.) are presented.